La décima plaza y los siete puntos de ventaja sobre el descenso, pueden hacer pensar que el objetivo de la permanencia se ha logrado de una manera holgada, nada más lejos de la realidad, de hecho los apuros clasificatorios vividos por el equipo llevaron a un relevo en el banquillo a mitad de temporada,
La temporada 2011/2012 para el filial blanquiverde se resume en dos partes una con el italiano Pierini y otra con el olímpico Rafa Berges. En cuanto a la etapa de Alessandro Pierini en el filial cordobesista podemos decir que hasta la jornada trece el equipo llevaba un aprobado en cuanto a la competición liguera, ya que salvo la derrota sufrida en la primera jornada del campeonato, el equipo era de los menos goleados como local ya que sólo había recibido tres goles, aunque tambien hay que hacer referencia que como goleador era de los menos efectivos, con tan solo ocho goles a favor. Hasta la jornada sexta el once dirigido por Pierini no inauguró el casillero de goles como visitante y lo hizo en su enfrentamiento ante el San Fernando donde cayó por 4-1. El punto positivo de esta primera vuelta fue desde la jornada 3 hasta la 13, donde el Córdoba B estuvo invicto como local durante seis semanas consecutivas, pero más tarde desde la 14 hasta la 20 el equipo blanquiverde cogió una linea descendente y estuvo durante siete semanas consecutivas cosechando derrotas lo que determinó la decisión de los dirigentes del club de prescindir del tecnico italiano y firmar por lo que restaba de competición a Rafa Berges, quien de nuevo volvía a la casa blanquiverde tras su última estancia.
Con Pierini el equipo obtuvo un computo general de cinco victorias, tres empates y doce derrotas, con 13 goles a favor y 23 en contra, sumando un total de 18 puntos.
Con Berges el equipo sumó un total de 26 puntos lo que le llevó a conseguir el objetivo de la permanencia a falta de dos jornadas para la conclusión del campeonato liguero. El mister cordobesista supo inculcarle a sus hombres el ser competivivo, arma importante para que un equipo quiera conseguir logros en el deporte.
Hubo una parte de esta segunda vuelta en la que el Córdoba B estuvo durante seis jornadas sin obtener el triunfo, con dos derrotas y cuatro empates (jornada 29 a la 34). En el lado positivo hubo dos etapas con Rafa Berges en las que el equipo estuvo durante cuatro jornadas sin conocer la derrota y fueron las siguientes: la primera desde la jornada 25 a la 28 y la segunda desde la 35 a la 38.
Con Rafa Berges en el banquillo el Córdoba B obtuvo un bagaje general de seis victorias, nueve empates y tres derrotas. Como local sumó cuatro victorias, cuatro empates y tan sólo una derrota. Como visitante los numeros fueron los siguientes: dos victorias, cinco empates y dos derrotas, con lo que se puede catalogar de buena la campaña del filial bajo la direccion del mister cordobesista. Cabe reseñar que Berges tuvo como refuerzos para conseguir el objetivo de la permanencia a Toni Seoane y Mane, dos jugadores que habían estado ya en la disciplina blanquiverde, pero que se fueron al Lucena para jugar en Segunda B, pero la poca en el conjunto aracelitano hizo posible la vuelta de ambos jugadores al cuadro blanquiverde aportando las gotas de veterania dentro de su juventud a la plantilla.
En cuanto a los jugadores se puede decir que la temporada ha sido positiva ya que han sido varios los jugadores que han estado alternando entrenamientos con la primera plantilla, ademas de haber entrado en alguna que otra convocatoria con el primer equipo tales como los casos de Bernardo, Javi Lopez o Carlos Martínez.